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标题:[转帖]流水与DNA分析的质量评价

1楼
cusabio 发表于:2015-7-24 15:57:00
水的质量可以通过在其中的生物体进行评估。这种做法往往会导致错误,因为许多物种看起来很相像。因此,新的方法用DNA分析来代替。生物学家在波鸿鲁尔大学(RUB)优化了流程,使他们现在能够识别许多生物在一次使用短DNA序列的快速和可靠的方式。该成果已发表 在PLOS ONE杂志上。

生物多样性有助于专业知识的研究

专业的ELISA试剂盒可以检测工业,农业和人类住区上水体菌株; 一些生物无法生存,由于在溪流和河流中不断变化的条件。因此,它们的存在阐明了栖息地的质量。然而,专家能够识别其外观的基础上小动物的数量是在下降; 只有少数初级研究人员活跃在这个领域。进化与生物多样性有助于专业知识的研究。

数据库“DNA条形码”

为了这个目的,他们正在创建与“生命工程的德国条形码”协作数据库:在第一步骤中,合格的专家鉴定基于其外观的水生生物。随后,将动物的基因组中的短的特性曲线区段 - 例如条形码 - 被解码并送入数据库。有人谁希望找出哪些物种代表在水体,采取水样,序列所含的微生物的DNA,并针对数据库进行匹配。瓦斯科Elbrecht和弗洛里安·利斯博士还开发了一种创新实验室的协议,这使得这个所谓的DNA条码比以前快多了。他们能够取得样品后一周内查看千余只动物。即使是现在处于开发阶段,该方法正确识别的品种超过80%。它基于外部特征因此比物种鉴定更加可靠,并从波鸿生物学家相信,它们将优化在不久的将来配额。

评估系统已被调整到新的方法

在他们的研究中,波鸿为主的生物学家们还展示了DNA条形码的局限性。使用这种方法,它不能确定如何某一物种的许多个体可在水体被发现。既定评估标准水质,另一方面,不包括这样的数据。“这是可评估的系统出了问题,”弗洛里安·利斯说。“但是,在运行的水是非常动态;物种的频率强烈的自然原因,随着时间的推移而变化。因此,它是有道理的基于确凿的物种清单记录的质量,而不是过于关注频率。”
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