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标题:[求助] DNA甲基化芯片需要联系哪些厂家?

1楼
savage7777 发表于:2008-11-23 10:21:00

本人试验需要用DNA甲基化芯片检测细胞基因组水平DNA甲基化的改变,小弟以前未做过该类型试验。请教各位达人,该芯片需要联系哪些厂家,准备些什么材料等,不胜感激

2楼
anlai 发表于:2008-11-24 15:12:00
你需要芯片吗,还是需要做甲基化芯片。
3楼
apachi 发表于:2008-11-27 14:48:00

DNA甲基化芯片目前的供应商较多,如AgilentUHNNimbleGen等生物公司。国内的代理服务机构有上海康成,上海生物芯片有限公司(SBC),北京博奥生物等。

DNA甲基化芯片的实验流程大体如下:
1
、超声打断基因组
  将基因组DNA超声打断成400bp-500bpDNA片段;
2
、甲基化DNA免疫共沉淀
  a)  加热变性并将变性后的单链DNA样品分成两份;
  b)  其中一份单链DNA样品加入抗5’-甲基化胞嘧啶核苷抗体。
  c)  用免疫磁珠法分离b步样品中甲基化DNA片段的抗体复合物,样品中其余的非甲基化DNA片段被清洗;
  d)  纯化免疫共沉淀的DNA片段(MeDIP);

3
MeDIP Input DNA片段线性扩增
  使用Sigma WGA Kit对两份DNA上述片段(MeDIP Input)进行扩增。该步骤使检测的的灵敏度得到大幅度提升,用微量的检测样品就能得到精确的检测结果;
4
、荧光标记
  对MeDIP(Cy5)Input(Cy3)样品分别进行标记;
5
、芯片杂交
  标记后的MeDIPInput样品混合、变性,与甲基化微阵列检测芯片杂交;
6
、图像采集和数据分析
  用高解析度芯片扫描仪检测杂交信号;用专业商用分析软件对杂交结果进行数据提取、标准化、峰值分析、报告;
7
、提供实验报告
  包括详细的实验方法和芯片实验数据和图表。

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