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标题:亚马逊、因特尔技术用于基因组分析,效果杠杠滴!

1楼
妖精的口袋 发表于:2015-3-20 9:27:00

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3月17日,基因组数据管理和分析的公司GenomeNext宣布将利用的亚马逊云计算与(美国)国立儿童医院合作,完成26个群体的2504个个体的原始基因组数据分析。其中包括2504个全基因组测序以及2504个外显子测序。全部数据分析将在一周内完成,达产生近100TB的分析结果。这些分析数据将在接下来的几个月陆续发表。

国立儿童医院生物医学基因组中心的主任Peter White博士及其团队认为GenomeNext公司的分析结果与他们最初的分析具有很高的相关性,而且此次大规模分析可能发现新的突变结果。White博士说:“国立儿童医院战略目标是将基因组医学应用到儿科研究和医疗护理的多重领域。遗传疾病的快速诊断对新生儿非常重要,因此我们的初步目标是开发一套快速的分析流程,且有很好的临床诊断的准确性和可重复性。”

通过使用配备有因特尔处理器的亚马逊云平台,GenomeNext公司的基因组数据的分析能力提升至日处理1000份人类基因组数据。GenomeNext首席执行官James Hirmas表示:“此次工作的完成不仅为大规模基因组数据分析提供了开创性的时间参考,还证明了GenomeNext公司分析平台的功能,消除了测序数据分析的瓶颈,使得科研人员和临床医生跟上了大规模人口基因组数据分析处理的脚步。”该公司的目标是将新知识整合进GenomeNext的分析流程以帮助科研人员和临床医生检测出稀有的致病突变;获得越来越多的及多样的DNA测序数据;提升数据的分析整合能力。这些对精准医疗的加速发展至关重要。

因特尔生命科学总经理Ketan Paranjape说:“我们的目标是加速精准医疗的发展,将会继续努力提升计算机基础硬件、存储和网络产品以及优化软件,从而使得大规模基因组数据分析成为可能。”

亚马逊云计算首席数据科学家Matt Wood也表示:“随着测序更接近临床实践,生物信息学数据分析的能力需要跟上新的基因组数据的产生能力。很高兴能够利用大规模的云平台促进全球健康事业的发展。”

此次合作中的亚马逊云计算服务将由JHC Technology公司(亚马逊云服务技术支持企业)提供。

小编感叹:“生物信息学数据分析的能力需要跟上新的基因组数据的产生能力。”随着测序成本的下降,测序数据越来越多,而我们用于存储数据、分析数据的能力,却没有跟上数据增长的速度。不过,各大互联网巨头都意识到这一点:谷歌推出了人类基因组云端服务Google Genomics,不仅能存储数据,还提供数据分析服务。IBM派出了他们引以为傲的超级计算机沃森,帮助医疗人员从基因层面探究疾病病因。现在亚马逊和因特尔也参与到基因数据处理的工作中来。未来,还有哪些公司会加入这一行列,小编拭目以待!

来源:测序中国

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