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近日,华裔富豪医生陈颂雄出席了一档名为“60 Minutes” 的节目,表达他对当前基因组大数据的想法,并引发了讨论:陈颂雄的想法是否具有创新性; 该想法是否有可行性?
“如果能够收集全世界的癌症数据,癌症研究将会取得重大突破”这个想法一直激励着陈颂雄。事实上,如果收集到一部分癌症数据,也会有重大发现。但目前,大多数癌症都没有收集到足够的测序数据,所获取的表型上的信息也是有限的和零散的。目前,已有一些医疗中心和公司意识到这个问题,开始收集整理基因数据,例如Foundation Medicine公司在收集基因型数据,Flatiron公司收集表型数据。
在数据收集完成之后面临更大的问题是数据的共享。即便是各大研究中心同意共享数据,在执行过程也面临不少难题。例如,一些大型癌症中心只共享癌症特异突变位点,然而这些信息可能不包含诱发患者患病的突变,因此研究人员将会遗漏很多重要信息。
目前,在基因研究领域流行“联盟”,希望把所有分散的基因组数据通过适当的方法集中起来,并进行有效共享。
陈颂雄认为仅仅联盟是不够的,与其费力地去其他组织获取数据,不如从头开始构建全面丰富的数据库。因此,一些评论表示,陈颂雄提供了一个看上去不错的方案,但是缺乏可行的证明。如果陈颂雄只是建了一个独立数据库,可能会促进数据共享,但不能解决根本问题。如果他同时能更多更快的收集数据,建立一个完整的数据库,那么在其他组织或机构还在商榷数据收集及共享标准的时候,这个数据库将为科学家们提供更多的资源。
如果陈颂雄成功了不仅能帮助癌症患者更好的进行治疗,还将表明数据收集对未来医疗的重要性。他的想法同时也提醒了当今的医疗中心,如果不能更好地收集、分享及扩充数据,将无法创新。
来源:测序中国