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标题:牛津纳米孔测序再发力,升级平台即将发布

1楼
妖精的口袋 发表于:2014-9-17 9:28:00

Oxford Nanopore Technologies 正在致力开发新纳米测序平台PromethIon,新平台正是MinIon的升级版。

PromethIon将运用Minlon的原理,把十万个纳米孔整合到一块芯片面板,使用者可以同时进行更多样品的测序。使用者可以选择同时对96个微生物样品或者单个人的样品进行测序,目前,Minlon使用的芯片上包含512个纳米孔。

依赖于高效的酶,快速的化学反应和大量的纳米孔,这个系统每天可以产生300-400十亿级的碱基数量。这个设备看起来只有台式电脑那么大,而且很轻便。Oxford Nanopore计划于下月,在美国人类遗传学协会的年会上展示这台新仪器。

这台仪器的读长大约有7900碱基,错误率在13.7%左右,其中5.2%是替换错误,3.7%是插入错误,4.8%的缺失错误。

现在的DNA准备阶段需要很多步骤的设置,为了减少这个过程,公司正在致力于开发一个称作SpotOn-T的工作系统。通过这个系统,使用者可以直接在顶部加入DNA转座酶对DNA进行加接头处理,准备好的DNA将直接被加到纳米孔芯片上进行测序。只需要把样品放在这个系统上,后面的处理将会自动进行。

在经历了试剂R6,R7版本后,他们正致力于新的R8版本,新的版本将对GC含量高的DNA更敏感,有更好地2D效果,而且使用者也可以把R8的技术结合到R7上去使用。公司也将使用不同版本的Minlon去进行市场细分。

针对MinIon Brown提到,Minlon的一个新的应用是直接进行RNA测序,公司的研究人员已经实验证明,纳米孔系统可以直接对RNA进行测序。未来或许可以有直接的RNA kit

Oxford Nanopore 也在发展基于云服务的综合分析软件——Metrichor,力求让使用者能够更方便的上传他们的原始数据。MinIon 试用计划从今年春天开始投入使用,现在已经在20多个国家的500多个实验室进行了试用,很多人对我们的设备很感兴趣。我们的设备主要是为那些想自己设计实验并需要测序仪的PI设计的,几个大规模的测序中心没有采用我们的设备并不影响什么。”Brown说。

MinIon 仍然处于早期的试用过程中,所以还存在很多问题,但是最早的试用者们都拿到了我们最新的软件和化学试剂,而且我们也将通过网络平台给予技术支持。在关注中,我相信肯定有很多支持者也有很多不理解的人。”Brown说。

来源:测序中国
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