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8月15,纽约(GenomeWeb)——Fluidigm已经宣布计划根据其CyTOF质谱流式细胞仪,推出一个成像系统。Fluidigm目前正在组织早期用户,帮助其完善预期在2015年商业发布平台。
该公司计划今年年底将原型放在两个或三个实验室,将对设备的进一步发展进行合作,Fluidigm首席技术官Scott Tanner告诉记者。
Tanner是多伦多大学的一个研究小组的成员,研发了CyTOF。他接着发现了DVS科学公司的质谱流式细胞仪。DVS科学公司今年1月被Fluidigm收购。
DVS公司的CyTOF质谱流式细胞仪,结合流式细胞术和原子质谱的能力,可以测量大量的高通量单细胞的蛋白质。原子质谱检测蛋白质利用稳定的同位素的抗体,然后可以通过高分辨率的质谱仪进行阅读。
今年3月,苏黎世大学的研究员Bernd Bodenmiller和瑞士苏黎世联邦理工学院的研究员Detlef Günther领导的研究小组,在Nature Methods上发表了一项研究,他们在CyTOF分析之前附加激光消融系统,以使用此平台进行成像研究。
将这项技术应用于乳腺癌肿瘤的研究,研究人员能够同时使32蛋白质在亚细胞分辨率下成像。Fluidigm公司已授权来自瑞士团队的激光消融技术,并与此团队继续合作系统的研发。
自从此研究发表以来,Bodenmiller告诉记者,他和他的同事们使用了CyTOF激光消融系统的最新版本——CyTOF 2,提高了方法的灵敏度,同时也开发了额外的靶点抗体,使他们能够同时测量蛋白质总数达到43。
这些增加主要集中在信号转导路径与肿瘤微环境,Bodenmiller说。
“我们努力得到的抗体,使我们能够区分不同的细胞类型,通常在微环境中会遇到,同时抗体告诉我们不同的细胞类型的功能状态,”他说。理论上,CyTOF能够同时测量100个分析物范围内提供所需金属耦合抗体。
Bodenmiller补充说,关键是设备的开始研发突破了Günther实验室将激光光斑的大小降低到亚细胞分辨率水平。CyTOF成像平台提供1微米的分辨率。Tanner说,现在主要集中早期计划即开发软件分析CyTOF成像数据。此类软件的工作仍处于早期阶段。
Tanner预计现有CyTOF用户会对此平台的发布产生兴趣——尤其是运行此设备的作为核心实验室服务的研究范围的一部分。
他补充说,他预计将吸引“传统上对免疫组织化学、免疫荧光显微镜或MALDI(成像)感兴趣的研究人员,想要看看CyTOF的深度信息。”
对后一种类型的客户而言,CyTOF成像系统可能会与通用电气医疗集团MultiOmyx蛋白质检测系统进行竞争,该公司去年通过其Clarient诊断服务推出。
通用电气公司全球研究生物学家和平台的开发领导者Michael Gerdes去年在一次采访中,告诉记者,公司研究人员在一个样本中测量多达65个蛋白质,可能多更多。
斯坦福大学的实验室研究员Garry Nolan,是最早使用质谱流式细胞仪的人,他也开发了一种使用质谱和金属耦合抗体的技术进行高度复用蛋白质在亚细胞水平的分析。
在一篇发表在Nature Medicine大致与CyTOF成像并行的研究中,Nolan和他的同事使用二次离子质谱在扇形磁质谱仪进行测量分辨率约200纳米的多蛋白质。
来源:中国生物器材网译
原文:Fluidigm Refining CyTOF Imaging Platform in Anticipation of 2015 Commercial Release