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标题:NEJM:下一代测序挽救14岁免疫缺陷综合征少年生命

1楼
妖精的口袋 发表于:2014-6-6 9:36:00

除了我们平时所熟悉的无创产前胎儿DNA检测,近日下一代测序在临床上又取得了重要突破:美国加州大学旧金山分校的研究人员通过下一代测序成功确诊并挽救了一位14岁入院六周一度陷入药物引起的昏迷状态,并患有联合免疫缺陷综合征少年的生命。

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美国加州大学旧金山分校的研究人员近日使用新一代基因测序技术,成功确诊并挽救了一位14岁患有联合免疫缺陷综合征少年的生命。研究刊登于64日的影响因子高达51.658的《新英格兰医学期刊》(The New England Journal of Medicine)。研究人员表示,该项技术并没有人们想象中那么遥远,以后所有感染病菌的患者都可通过这项技术获得明确诊断,基因测序将是未来大趋势。

患者病情回顾

患者在长达4个月的时间内一直出现发热和头疼症状,病情一直没有得到有效控制,最后发展为脑积水和癫痫状态。医院使用各种诊疗手段都没有起到作用。最后医生通过对脑脊髓液进行基因测序,诊断出该患者在脊髓液中有钩端螺旋体病菌,并用最普通的盘尼西林将该患者治愈。

根据加州大学旧金山分校(UCSF)医学实验室的华裔教授Charles Chiu介绍,在对脑脊髓液和血液进行分析仅仅48小时后,该男孩就得到了快速的诊断和成功治疗。

这预示着下一代测序(NGS技术将在解开传染病谜团中的具有更广泛应用:不仅可用于前沿的研究机构,而且可用于随处可见的、医生可以接近的临床实验室。

采用NGS技术大大缩短了样品采集和可行诊断之间所需的时间,帮助威斯康星大学的一个医疗小组挽救了年轻患者的生命。

这项研究将实时DNA测序、庞大的基因组数据库(用于识别病原体和其他生物体)和先进的计算分析工具(快速分析数百万个数据点)融合起来,不仅可以同时识别患者样本中的所有DNA,而且无需培养或靶定特定的传染病原体。

从成本和周转时间的角度来看,这是一项非常强大的技术,已成为切实可用的临床实验室常规实施技术。

目前,一些临床实验室可提供NGS检测,以确定临床试验中的癌症突变,并确定出生缺陷相关的突变。

但直到现在,NGS一直被视为过于缓慢和费力,因此对常规的传染病诊断不太有用。

然而诸如脑膜炎和肺炎的疾病一直困扰着医学界。现在有超过半数的脑膜炎和30%的肺炎疾病都仍然属于医学空白领域,无法进行明确诊断。

基因测序产业链分析

基因测序产业链,上游为测序仪器和试剂供应商,中间为基因检测服务提供商,下游对象为医院,药企,科研机构和病人。

在美国,大约有2万人(主要是儿童),每年因脑肿胀脑炎入院,有4000多人因脑膜炎入院。在几乎一半的脑炎病例中,并没有发现病因,然而,本案例指出,如果不能将传染与自身免疫区分开来,可能会引起更严重的病情。

在国内,从事临床测序的企业有华大基因和贝瑞和康,前者收购美国著名测序公司CG公司,产品正在寻求国内审批,而后者于全球测序巨鳄Illumina联手生产测序仪。

然而早在2004年已经在A股上市的达安基因(002030.SH)目前呈现后来居上的趋势,公司与Lifetech合作的IonProton测序平台DA8600已经申请报证审批。

来源:生物探索

[此贴子已经被作者于2014-6-6 9:38:39编辑过]
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