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标题：[原创]各类生物学软件资料大全，分享给大家。。要的低价出货

1楼

copydogcn 发表于：2007-12-28 20:49:00

软件生物芯片　
ScanAlyze 2.51 进行微阵列荧光图像分析软件。
Cluster 2.20 对大量微阵列数据组进行分析处理的软件。
TreeView 1.60 用图形来显示Cluster软件分析的结果软件。
ArrayMaker v2.6 stanford大学Brown实验室提供的基因芯片研究全套设备相配套的软件与文档。
J-Express pro 2.7 分析微阵列（microarray）实验获得的基因表达数据的软件。
ArrayVision 8.0 R5 Demo 用来方便定量基因表达阵列分析的软件。
IconoClust 2.5 Demo 用微阵列图像分析软件30天全功能演示版。
MAExplorer Version 0.96.34.01 基于JAVA程序的微阵列数据库数据采集软件。
FreeView和FreeOView 基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据。
dchip 2006 DNA芯片分析软件。
SAM 3.01 微矩阵显著性分析软件，EXCEL软件的插件。
BRB-ArrayTools 3.6.0b1 显示和统计分析DNA微阵列基因表达数据软件包。
Pusamen 1.0 微阵列数据管理和分析中文软件。
AMADA 2.0.7 用来组织、研究、显示、分析微阵列(Microarray)数据软件。
DNA_MAP 1.0 分析显示微阵列(Microarray)数据软件。
GalFileGenerator v1.4 数据转换软件。
Array-A-Lizer 1.03 DNA阵列实验结果快速分析软件。
cluster 3.0 日本学者编写的cluster软件的增强版。
ExpressionSieve Lite 微阵列数据分析与显示软件包简化版。
GenePattern 3.0.3.0.779 MIT学者用JAVA语言编写的表达分析高级生物医学分析软件平台。
GenMAPP 2.1 基因表达微阵列数据进行分析并图形化显示软件。
MADAM v4.0 微阵列数据管理器。
Spotfinder 3.11 快速分析微阵列图像工具软件。
MIDAS 2.19 微阵列数据分析系统。
MeV v4.0 通用微阵列分析工具。
TreeArrage 对微阵列表达数据进行重新排序和聚类分析软件。
Java Treeview 1.1.0 开放源代码的微阵列数据显示软件。
EXPANDER 3.2.1 基因表达与显示软件包。
OligoArray 2.1 基因组规模微阵列的寡核苷酸探针设计软件。
BAGEL 3.62 微阵列数据统计分析软件；
CAGED 1.0 基因表达数据分析软件；
GAAS 大规模基因表达数据分析、显示与储存软件；
GLR 微阵列数据统计分析软件
ANOVA 2.0 微阵列基因表达数据统计软件；
Rosetta 基因表达数据分析系统
一系列使用office中的EXCEL宏文件编制的芯片数据处理和分析模板
standford大学一位教授写的数个芯片数据分析小程序及源程序
UCSF Spot 另一个微阵列扫描图像分析软件；
ArrayMiner 5.3简易版微阵列数据分析软件；
Venn Mapper 1.01 比较非同源微阵列数据软件
MAIA 2.7 Demo 微阵列图像分析软件。
MAGIC Tool 1.6 微阵列数据图像分析软件。
Array Tools 3.3 微阵列数据处理excel插件。

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业务联系电话：13017525669 联系QQ：3385251
邮件：copydogcn#126.com
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请按Clrt+F查找，输入软件关键字查询（不要输入版本号）

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检索与阅读
超星图书阅览器 4.0T 在线读取超星图书馆网上电子图书的客户端软件。
PubCrawler2.2 Medline文献库与GenBank核酸序列库检索软件。
CajViewer 7.0 读取中国期刊网电子期刊全文所必备的阅览器。
国图浏览器浏览中国数图的必备软件。
书生阅读器 7.0 浏览书生之家数字图书馆的必备软件。
Scholar's Aid 4 AE版文献参考资料等日常资料的整理软件。
医网打尽 6.0版主要用于生物医学类和普通类搜索中文软件
JaniSearch 0.4 智能搜索软件,包含16个医学、生物学相关的搜索引擎。
药审中心受理品种搜索专家2.27专业版可以直接从国家药品审评中心的数据库搜索指定药品的受理号、厂家、申报时间、审评进度、付费情况等详尽资料
蓝宙非处方药大师1.03版收集整理了将近4000个OTC品种的详尽资料
中国爬行动物检索王1.0 东北林业大学开发的国内第一款动物学方面的检索软件
医学文献王2.0试用版医学文献管理软件。
SCIip 2005年度SCI影响因子(impact factor)查询工具
PubAbstracts PubMED摘要整理工具
AgilentLS 2.3 文献检索软件。
EasyKey 1.0 生物物种检索系统。
NoteExpress 1.9.2.192 中文文献检索与管理系统。
Apabi Reader 3.1 方正Apabi阅读器。
质粒绘图　
Plasmid Processor 1.02 绘制质粒图软件。
pDRAW 1.1.93 DNA分析与绘图软件,可绘制线性或环形DNA图。
Visual Cloning 3.2.4 Demo 是有名的绘制质粒图Redasoft Plasmid 1.1软件的升级版。
SimVector 4.20 Demo 质粒图绘制软件。
CloneMap 2.11 Demo 质粒作图软件演示版。
ApE 1.11 质粒构建与显示及绘制软件。
BVTech Plasmid 1.0 质粒绘图免费软件。
pCIRCLE 3rd Flash MX 2004 制作的用于绘制环状质粒的软件
Plasm 1.4.0 质粒绘图软件。
XPlasMap 0.9 苹果电脑的质粒绘图软件。
PlasMapper 2.0 在线绘制质粒工具。
NetPlasmid 在线质粒绘制工具
Savvy v0.1 在线质粒绘制工具。
RNA分析
RNAdraw 1.1b2 RNA二级结构分析软件。
RNAstructure 4.5 预测RNA二级结构图。
RnaViz 2.0 RNA二级结构图绘制程序。
loopDloop 2.07b Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件。
Circles 0.1.0 使用比较的方法分析RNA二级结构软件。
SStructView 1.2 用JAVA脚本语言写成的RNA二级结构显示软件
Vienna RNA Package 1.6.4 维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包
XRNA1.1.12b 基于java的生成、显示、注释RNA二级结构的软件
STAR Demo RNA结构分析软件
PseudoViewer 3.0 RNA二级结构显示软件
OligoEngine RNAi设计软件
KineViewer 查看RNA折叠在线预测KineFold结果的软件，
RNAshapes 2.1.1 分析RNA二级结构软件
pknotsRG 1.3 预测RNA二级结构软件，
miRanda 1.0b 查找基因组中潜在的RNA位点软件，
RNAz 1.0 预测结构保守热稳定RNA结构软件
RnaFamily java编写的用于显示一个RNA分子族的所有二级结构小软件
RNApasta 070518 Java语言所写的比对和结构注释RNA序列统计分析工具
CLC RNA Workbench 1.0.1 分析RNA序列的综合工具
siDirect 在线RNAi设计软件
tRNAscan-SE 在基因组数据中寻找tRNA基因的在线工具
序列格式转换
vised 1.1 序列输入分析和格式转换软件。
ForCon 1.0 多序列文件格式转换软件。
SeqVerter 2.0.3.7 序列格式转换软件。
GeneStudio Pro 2.1.0.0 序列格式显示、编辑与转换工具软件。
FASTA/BLAST SCAN 2.3 FASTA与BLAST查询输出文件的处理软件。
RevComp 2.4 序列格式转换软件。
MatchCode2.0 将蛋白和核酸序列进行简单匹配和格式化输出的中文软件。
BioCocoa 2.0 提供给软件开发者Objective-C语言的各种序列格式的读写支持模块
DNACompress 免费的DNA序列压缩软件
SeqnConverter 3.0 将不同格式的序列文件转换成FASTA格式软件。
APSC 1.0 蛋白序列格式转换工具。
Readseq 2.1.24 序列编辑与格式转换软件
ETSTools EST数据库建立系统辅助软件
XML2PDB XML格式3维分子文件转换为PDB格式文件的软件
DNAsmac 1.5.0 序列管理与格式转换软件；
DataConvert 1.0 还增加序列格式转换软件软件。
Fasta2MultiFasta v1.7 将多个单序列fasta格式文件合并为多序列fasta格式文件软件
abi2xml 1.2 将ABI格式的DNA序列文件转化为XML格式文件的软件
PCR相关　
primer Premier 5.0 Demo 引物设计工具。
Oligo 6.71 Demo 引物分析著名软件。
Primer D'Signer 1.1 专门用于pASK-IBA和pPR-IBA表达载体免费的引物设计辅助软件。
Array Designer 4.24 Demo 批量设计DNA和寡核苷酸引物工具，
Beacon Designer 7.01 Demo 实时荧光定量PCR分子信标(Molecular beacon )及TaqMan探针设计软件。
NetPrimer JAVA语言写成的免费引物设计软件。
e-PCR 2.3.7 识别DNA序列标签位点（STSs)电子克隆软件。
FastPCR 5.1 快速设计各种类型PCR引物软件。
OligoMaster 1.0.151 多用户寡核苷酸管理软件。
TGGE-STAR PCR结合梯度凝胶电泳实验引物设计软件。
PerlPrimer v1.1.14 免费的用来设计引物的开源软件。
AmplifX 1.4 设计与管理引物的软件。
AutoDimer 1.0 快速筛选二聚体引物软件。
MutaPrimer 1.00 用于定点突变的引物设计桌面工具
ORFprimer 1.5.1 JAVA语言设计的引物设计软件
Primer Prim'er 5.6.0 Flash制作的PCR引物设计软件。
The Primer Generator 在线引物设计程序。
Primer 3 比较有名的在线引物设计程序。
Primo Pro 3.4 在线PCR引物设计java系列软件。
Web Primer 斯坦福大学提供的在线引物设计软件。
AutoPrime 快速设计真核表达实时定量PCR引物在线软件。
生物化工　
FRAE 2.01 发酵记录分析专家。

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蛋白质分析　
ANTHEPROT 5.2 蛋白序列分析软件包。
pSAAM 蛋白序列分析软件包。
VHMPT 螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件。
WinPep3.01 分析蛋白序列的工具软件。
MPEx 3.0 研究膜蛋白拓扑学结构和其它特性的JAVA软件。
Osprey 1.2.0 蛋白质相互作用网络可视化系统
PIN 2.0 显示蛋白质交互作用网络和功能注释软件。
InterViewer 4.0 显示和分析蛋白交互作用软件
Fiter 1.0 对蛋白质的MALDI-TOF分析结果数据进行数据滤除的免费中文软件
GPMAW 7.10 DEMO 蛋白质质谱与序列分析软件；
STORM 1.01 同时对蛋白序列进行BLAST/FASTA/Pfam/ProtParam分析软件
PIVOT 2.0 显示蛋白交互作用图的JAVA软件
WinPep3.01 蛋白质分析栏目增加分析蛋白序列的工具软件
PAT 0.9 JAVA语言写成的蛋白序列比对工具
CLC Protein Workbench 3.0.3 Demo 蛋白序列分析软件
ProTag 1.3 Office软件的插件蛋白标签软件。
生化教学　
mmp.zip 将生化代谢中的各种途径用图表的形式表示出来。
linpath.zip 线性酶反应模拟软件。
protlab 3.01 蛋白质纯化仿真软件。
MOLMED.ZIP 生化基础概念演示教学程序。
Biochem1.75 生化教学文件。
photo 光合作用教学程序。
《生物化学》练习题软件本套题共包括14章内容，每章练习题有单项选择和多项选择两套题，题库总题数近700道。
Adrenalin 肾上腺素在肝糖原代谢中的作用演示。
金排生物画板 6.2 专门用于编写生物类教学文档工具软件。
中文生物化学三大代谢图
Virtlab 2.0 用于教学目的的虚拟的分子生物学实验室软件
GENUP 5.3 定量遗传学辅助教学软件。
hands on genetics 2.0 12个生物教学程序
ScienceMatrix Demo 细胞结构和功能教育软件。
Digital Frog 2.5 数字青蛙
CTB 2.0 细胞、组织、身体动画图解软件
Molecular Genetics 3.1 教学软件
趣味生物软件　
Life32 2.16 这是目前运行最快的细胞生命程序。
Primordial Life 3.21 原始生命屏幕保护程序。
breeder 3.0 培养杂交植物的小游戏。
Cafun 1.0 使用细胞自动机模拟复杂的自然界现象软件。
Molecular Expressions 演示显微镜下的分子图形。
Irving Geis SS 分子生物学内容的屏幕保护。
cyclovir.exe 一种抑制DNA复制药物Acyclovir机理演示的屏幕保护程序。
ProteinMusic 1.1 用JAVA语言编写的将DNA序列转换为音乐的软件。
DNA Coder v1.5 DNA碱基加密文件资料的软件。
Dancer DNA 1.2 将音乐转化为DNA信息，进而转化为屏幕上多变的虚拟生物软件。
MP 2.0 彩色荧光生物学图片屏幕保护程序。
Screensaver Protein Builder 2.0 蛋白折叠分布计算屏幕保护软件。
Folding@home 5.03 运用分布式计算技术运算蛋白折叠屏幕保护程序。
d2ol 2.0 运用分布式计算技术进行药物研究的屏幕保护程序。
3D BioMolecula ScreenSaver 1.1 三维生物分子屏幕保护程序。
3D DNA Screesaver 1.0 三维DNA分子屏幕保护程序。
LIVING CELL 3D SCREENSAVER 1.3 3D细胞屏保
3D CHEMICAL ELEMENTS SCREENSAVER 三维化学分子屏保
Cube screensaver 安玛西亚的层析图片屏幕保护程序
INSIDE THE CELL 3D 3D细胞屏保
Pus-Poppin Frogs 1.0.1 关于SNP和药物副作用关系的游戏；
VEM 一个虚拟电子显微镜小游戏
Microbworld “微生物世界”屏保。
Bio2MIDI v2.1 将DNA序列或者蛋白序列文件转换为音乐的软件。
三个遗传flash游戏 GSK（葛兰素史克制药公司）的游戏。
Bugs 2.0 模拟微生物生长繁殖的软件
Binary 显示DNA序列屏幕保护程序
DNA Screensaver 1.0 三维DNA序列屏幕保护程序
DNA Helix 1.0 DNA双螺旋屏保
Gene Pool 5 人工生命模拟软件。
Darwin Pond 人工生命模拟软件。
化学绘图
ACD/ChemSketch 10.0 绘制分子结构的免费软件。
Chemfont 97 化学符号与Ture Type字体,可以在WORD中直接插入文章中.
ISIS DRAW 2.5 绘制化学结构式的免费软件。
Marvin 4.1.13 JAVA语言编写的小巧好用的化学结构式绘制程序。
ACD/Structure Drawing Applet 1.30 绘制化学结构式免费JAVA小程序。
CarboDraw 1.0 免费的绘制碳氢化合物化学式软件。
化学金排 9.0 基于WORD平台的一套化学专业排版辅助中文软件
小猪化学分子结构模型编辑器用于建造三维化学分子结构模型的应用程序。
ChemFormatter 1.2.4 760K，方便输入化学符号的word的免费插件。
1LanzCHE 一个化学符号与Ture Type字体
Chemistry 4-D Draw Demo 化学绘图软件
JChemPaint 2.21 java语言编写的免费分子结构编辑器。
ChemDraw Ultra 11.0 Trial 很有名的化学绘图软件，可试用两周，请到原始网站申请试用码。
序列综合分析软件　
Geneious 3.0.6 序列综合分析软件；

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2楼

copydogcn 发表于：2007-12-28 20:50:00

DNA分析
JaMBW 1.1 分子生物学软件包。
ANNHYB 4.938 用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件。
Chromas 2.32 ABI格式文件显示与编辑软件。
DNAProbe 核苷酸序列设计工具。
DnaSP 4.10.9 基因多态性分析软件。
DFW 2.51 trail DNA分析软件。
Artemis R9 以Java语言写成的序列查看工具。
ACT R6 以Java语言写成的序列比较查看器。
GDA 1.1 主要用来进行不连续基因数据的统计分析。
Sequencher 4.7 Demo 序列拼接软件。
MeltCalc 2.06 自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件。
ConsInspector 3.3 DNA蛋白结合位点预测识别软件。
GenomePixelizer 2003.10.1版帮助理解基因组中的簇基因（clustering gene）之间的相互关系的软件。
Gene Construction Kit 2.5 Demo 管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件。
GenescanView 1.2 查看基因扫描（genescan）格式.fsa文件的小软件。
Sequin 7.77 数据库GenBank, EMBL, DDBJ 查询软件。
DNAuser 1.0 DNA序列处理软件。
GenomeComp 1.3 中科院生物物理所生物信息实验室推出的可视化的微生物基因组比较工具
Apollo 1.6.5 Java语言开发的基因组注释显示编辑软件
SNPHunter 1.75 SNP（单核苷酸多态性）查找软件。
SSRHunter 1.3 SSR（Simple Sequence Repeat，即简单序列重复，又称微卫星DNA）位点查找软件。
iCE 3.5 Java语言编写的显示基因指纹图及相关数据的软件
MB6.84 免费的DNA分析软件
FinchTV 1.4 免费的DNA图谱分析软件；
Sequence Scanner v1.0 显示分析ABI基因分析仪DNA图谱数据软件，
CodonCode Aligner 2.0.1 DNA测序trace图编辑、突变分析、contig编辑、序列拼接软件。
WinGene 2.31 分析核酸序列的多用工具软件；
BioLign 4.0.6 还增加免费序列拼接软件；
PIC_Calc 0.6 多态信息含量计算程序。
SequenceViewer 1.0 DNA序列图形显示软件；
SERIAL CLONER 1.2 DNA序列分析工具软件
Xplorer 2.4.2 DNA图谱查看分析软件
生物化工　
brd.zip 生物反应器（发酵罐）设计软件。
BioStat 4.3 BioStat B发酵罐控制程序。
PenSim v2.0 青霉素发酵模拟软件。
BioProSim 4.0 发酵实时模拟软件。
SuperPro Designer 6.0评估版计算机辅助设计特别是生物工艺设计的软件包。
FRAE 2.01 发酵记录分析专家。
进化分析　
phylip 3.65 进化树分析软件，并可绘制进化树。
TreeView 1.6.6 进化树处理软件。
GeneTree 1.3 比较基因与种系进化树的程序。
NDE 0.5.0 用来编辑NEXUS格式文件的程序。
TreeMap 1.0 用来可视地比较主、从进化树的程序。
Spectrum 分析进化信息而不用将之转化为进化树的软件。
Phyltools 1.32 计算与处理进化树数据的软件。
tree-puzzle 5.2 核酸序列、蛋白序列相似性分析及进化树构建工具。
ATV 1.92 JAVA语言编写的显示"New Hampshire"与NHX格式的进化树文件软件。
TREECON 1.3b Demo 构建和绘制进化树的软件包。
ProBiosys 0.9 比较表现型分类法数据和分析计算核酸序列数据距离值的软件。
COMPONENT 2.0 分析进化树免费软件。
NJplot 小巧的显示进化树的免费软件NJplot。
MEGA 4.0 免费分子进化遗传分析软件
PAUP 4 PAUP的快速使用手册
TreeSAAP 3.2 蛋白序列进化分析软件；
mesquite 2.0 进化分析软件
PAL 1.51 进化分析java程序库；
Vanilla 1.2 使用PAL编写的进化分析命令行程序；
SplitsTree 4.8 JAVA程序编写的分析和显示进化数据软件；
TCS 1.21 JAVA程序所写的进化网络分析软件；
GEODIS 2.5 进化分析软件；
RDP 3b22 重组分析软件
FastME 1.0 快速精确的进化树软件；
REAP DOS下的进化分析软件包；
T-REX 4.01 进化树构建分析软件；
FSTAT 2.9.3.2 基因差异分析软件；
ProfDist 0.9.7 构建大进化树软件
STC 1.2 新的算法构建进化分析软件，
SymmeTREE 命令行差异分析软件
Phylogenetic Visualization tool 进化树显示工具
TREEFINDER 200706版计算进化分析软件
PHASE 2.0 序列进化分析软件；
BAMBE 2.01b 分子生物进化分析软件；
MODELTEST 3.7 核苷酸替换DNA进化最优模型分析软件
MTgui 1.5 MODELTEST图形操作介面软件
Clann 3.02 以色列科学家编写进化树分析软件；
Phylogenetic Independence 2.0 进化独立性分析软件；
Jevtrace2 v3.12b JAVA语言写的进化分析软件；
NimbleTree 2.6 建立进化树软件；
Phyl-O-Gen 1.1 构建进化树软件；
BEAST 1.4.6 贝叶斯进化分析软件
MESA 1.9.23 宏进化分析和模拟软件；
TreeJuxtaposer 2.1 进化树比较分析软件；
TreeExplorer 2.12 进化树绘制显示软件；
TreeMe 03/2007 进化树生成和显示软件；
DNATREE 1.2 DNA序列进化分析软件
Genie 3.0 系谱间隔分析软件
Pebble v1.0 进化分析软件；
ArboDraw 进化树绘图软件
PhyloDraw 0.82 进化树绘图软件.
MrBayes 3.1.2 进化树分析软件；
Network 4.201 进化树生成软件；
PhyDE 0.993 进化数据编辑器；
PRAP 1.21 Parsimony ratchet分析软件
图像处理　
Image Tool 3.0 科学用途的处理图像软件。
Image J 1.38 用Java语言写成的科学用途的处理图像软件。
Cross Checker 2.91 基因指纹图分析软件。
ALFmap 1.22 ALF (Amersham Pharmacia) 图像格式转换软件。
Band Leader 3.0 凝胶图像处理软件。
Scion Image 4.03 图像处理与分析工具。
OSIRIS 4.19 通用医学图像处理与分析软件。
Melanie Viewer 6.0 免费Melanie图像查看器。
TotalLab v2006c 评估版图像分析软件。
LabImage 2.71 评估版凝胶图像分析软件。
QuantiScan 3.0 Demo 使用简单功能专一的凝胶扫描、分析软件。
Engauge Digitizer 4.1 图形数字化软件。可以将曲线图转化为数据与等式。
Graph Digitizer version 2.16 图形数字化软件。
Peak Explorer 2.11 处理试验图谱图像软件。
电泳图谱绘制器1.0 处理电泳图谱图像软件。
Volocity LE 4.2.1 免费显微图像处理软件。
GetData 2.22 图像数字化处理软件。
Bersoft Image Measurement 5.1 图像数字化处理软件。
DigitizeIt 1.5 图像数字化处理软件。
CellC v1.11 微生物显微图像处理软件。

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三维分子类　
RASMOL 2.7.3.1 观看生物分子3D微观立体结构的软件。非常有名，巨棒！
RasTop 2.2 为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件
MolMol 2k.2 将pdb等格式的蛋白文件通过微调，存成普通的图形文件。
CrystInfo 1.0 用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3d结构。
DS Visualizer 1.7 3维分子浏览工具。
ICM-Browser 3.5 3维分子浏览工具。
VMD 1.8.6 3维分子浏览工具，可以进行动态显示。
CN3D 4.1 3D分子结构观察软件。
WPDB 2.2 PDB文件检索显示分析软件。
DTMM 4.3 Demo 3维分子模型显示、编辑与构建程序。
gopenmol 3.0 显示并分析分子结构及其特性的软件。
POV-Ray 3.7b23 生成三维图像工具软件。
MegaPov 1.2.1 3D渲染软件POV-Ray非官方编译软件。
Mol2Mol 5.6.0Demo 分子文件格式转换软件。
MolPOV 2.0.8 将PDB文件转化为POV格式文件的软件。
PovChem 2.1.1 将PDB文件转化为POV格式文件的软件。
Ortep-3 1.08 生成分子的热椭圆形点图软件。
PLATON 1.12 通用结晶学软件工具。
Mage 6.44 读取并演示Kinemage格式文件的专用软件。
Prekin 6.42 将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件的软件。
KiNG 2.13 三维分子Kinemage的显示软件。
Swiss-PdbViewer 3.7 sp5 PDB文件显示与分析软件。
StrukEd Demo 化学分子编辑与三维模型生成软件。
JMVC 4 041122版使用JAVA技术编写的三维分子查看器。
Re_View 1.0 读取及分析XYZ格式三维分子文件的软件。
Oscail X 2007 Ver 2 用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包。
Moilin X 2007 分子构建与观察软件。
Tinker 4.2 与Moilin配套的DOS下的分子设计建模软件。
Biodesigner 0.75 免费的分子建模与显示软件。
MoluCAD Demo 02年11月版全功能的分子建模与显示工具软件。
DS Visualizer ActiveX Control 1.7 三维分子显示控件。
ACD/3D Viewer for ISIS 4.5 免费的ISIS Draw三维显示插件。
PyMOL 0.99rc6 免费且公开源代码的三维分子显示、动画、编辑程序。
Qmol 3.01 基于OpenGL的三维分子显示软件。
Protein Explorer 2.80 RASMOL衍生出的软件。
WinMGM 2.0b 分子图像程序。
Chimera 1.2470 免费的交互式分子模型显示程序；和
Jmol 11.2.14 java语言写成的开放源代码的免费三维分子显示程序；
Ramachandran Plot Explorer 1.0 蛋白分子显示软件；
ProteinScope LE 1.0.5 免费PDB蛋白三维显示软件
CHIME 2.6 SP7 直接在浏览器中观看3D分子。
YASARA View 7.12.5 免费分子显示软件
NOC 3.01 免费的蛋白3维结构构建、显示、分析软件2；
3DNA 1.5 分析、构建、显示核酸三维结构的软件，
ArgusLab 4.0.1 分子构型、绘图和药物设计软件；
CueMol 1.1.0.176 免费的分子结构显示和三维渲染软件；
MOLDA 6.5 r2 分子模型构建程序；
jimp 2 0.091 显示三维分子软件；
SweetMollyGrace 1.2 三维分子渲染与动画软件；
Facio 11.2.1 三维分子建模、显示与量子化学计算程序；
VEGA ZZ 2.1.0 支持多种三维格式并可进行显示、计算、分析的免费软件；
GDIS 0.773 三维分子显示软件。
PDBlib 2.2 显示PDB文件的C++库，可用于编程。

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3楼

copydogcn 发表于：2007-12-28 20:51:00

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化学应用　
mmcalc 1.8 分子量计算器。
Chemical Calculator 6.0 化学试剂制备计算器。
ChemBalance Wizard 1.0 Win95下的免费化学方程式配平程序。
periodic table 1.0 小巧的元素周期表。
Periodic Table 3.54 se 高级元素周期表。
CFT 1.3 化学式教师。
元素屋 3.6 查询112种元素的各个信息的中文软件。
化学反应方程式编辑器 1.0 制作化学反应方程式、离子方程式、分子式、离子式等。
CRS 1.3 化学反应方程式配平器
Model ChemLab v2.5体验版化学实验教育软件及其汉化版
化学品电子手册 3.0 本电子手册是一个综合性的化学品手册。
Molecular Weight Calculator 6.42 免费的分子量计算器。
数据处理　
GraphPad PRISM 4.0 Demo 著名的数据处理软件。免费的Prism 文件浏览器Free Prism Viewer 4.01。
SigmaStat 3.5 Demo 智能统计软件 30天全功能演示版。
PeakFit 4.12 Demo 自动分离、拟合与分析非线性数据软件。
数据作图助手II v2.1_A 对实验结果进行数据分析和作图的专业软件。
正交设计助手II 3.0 正交实验设计辅助工具软件。
CurveExpert 1.38 实验数据处理绘图软件。
NoSA5 2005.6.13版中文非典型数据统计分析系统。
DRS 2005 依据"最小三乘法"编制的数据回归分析软件。
TDMA 1.02 二剂量法生物效价测定软件
LD50 1.01 LD50数据处理程序
shyfxExcel 3.1 农业试验统计分析软件
序列综合分析　
MACAW 2.05 多序列构建与分析软件。
Clustal W 1.83 用来对核酸与蛋白序列进行多序列比较的软件。
Clustal X 1.83 Clustal W Windows界面程序。
FASTA 34.26.3 数据库中查找同源序列软件。
GeneDoc 2.7.0 对序列进行相关分析等操作。
BLAST 2.2.16 与NetBlast2.2.16 数据库中查找类似序列的软件及客户端软件。
SeqPup 0.9 生物分子序列编辑与分析软件。
K-Estimator 6.1 进化基因学研究软件，评估两条核酸序列核苷酸替代数。
BioEdit 7.0.5 序列编辑器与分析工具软件。
DAMBE 4.5.53 综合性序列工具软件。
LaserGene 5.01 Demo 综合性序列工具软件。
SeaView v20070215 图形化多序列队列编辑器。
Jalview 2.21 用Java语言写的多序列队列编辑器。
DNASIS Max Trail 2.7 序列综合分析工具。
Genamics Expression 1.1 演示版是一个DNA与蛋白序列分析工具。
Vector NTI Viewer 4.0.1 载体查看软件。
Jellyfish 3.3 多功能序列分析软件。
ProSeq 2.9 beta 核酸序列编辑与种群遗传学分析软件。
SMS 2 DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具集合。
Staden 1.6.0 综合序列装配、编辑、分析软件包。
Vector NTI Advance 10.3.0 Demo 综合性蛋白核酸分析工具包。
ISYS v1.35 NCGR开发的用JAVA语言写成的数个不同类生物信息软件与数据库的软件集合平台。
DNAScriptor 1.00 DNA与蛋白序列综合分析软件。
PhyloGrapher（2003.4.3）用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件。
Woderful生物信息学系统2.5试用版综合中文序列分析软件。
bioxm 2.6 DNA序列资料的常规分析软件。
SeWeR 3.0 基于WEB的常用序列分析工具集。
WinBlast v.0.2.0 免费的NCBI BLAST程序windows界面程序。
SeqVISTA 1.81 java语言编写的核酸或蛋白序列图像显示、比较软件
GENOME EXPLORER 1.0b Java语言编写的生物信息学综合工具软件
PowerBlast 1.2.0 序列比较分析软件Blast的扩展软件
JAligner 1.0 基于Smith-Waterman算法的序列比对软件
DNAMAN 6.0 Demo 多功能综合序列分析软件演示版
CLC Free Workbench 3.2.3 免费的生物信息学综合软件。
MAFFT 6.240 多序列比对软件。
TuneClustalX 多序列比对软件
Exonerate 1.3.0 比对软件
Lalnview 3.0 双序列比对图形显示软件；
NeoBio 1.0 pre-alpha 序列比对java软件；
STRAP 07.04.12版多序列比对交互软件。
Mauve 2.0.0 基因组比对软件；
Laj 05.11.4 用来处理、显示比对结果的软件；
YASS v1.12 本地序列比对工具软件
Utopia 1.2.1 包括三维显示软件Ambrosia和比对结果显示软件cinema的软件；
MolQuest trial 1.6.0.204 生物信息学工具软件包；
Geneious 3.0.3 序列综合分析软件；
GENtle 1.9.4 免费的DNA和蛋白序列编辑管理软件
Align-m v2.3 多序列比对软件
杂七杂八　
BioMedCalc 2.9 用于生物学和医学计算的生物信息学软件生物医学计算器
DNA分析　
PIC_Calc 0.6 多态信息含量计算程序。
序列格式转换　
ETSTools EST数据库建立系统辅助软件
XML2PDB XML格式3维分子文件转换为PDB格式文件的软件

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杂七杂八　
DynaFit 3.28.050 (生物)化学动力学与化学平衡计算程序。
Migrate 2.1.3 从遗传学角度，估算人口移民率程序。
arlequin 3.11 人口遗传学软件
FBAT 1.7.3 家族遗传相联检验的统计程序。
GGT 2.0 图形化基因型表示软件。
CERVUS 3.0 使用共显性标记数据推断亲缘关系的软件。
SBW 2.6.0 系统生物学软件包。
Gepasi 3.30 化学与生物化学反应动力学仿真与优化软件。
Map Manager QTX b20 回交、杂交与重组自交系分析遗传作图实验结果的软件。
FCSM 用来管理储存在液氮容器中的生物样品（例如细胞系、血清等等）的程序。
MICE 1.4 虚拟动物饲养设施，用来帮助管理饲养设施中的实验动物软件。
DBsolve 7.40 代谢及酶-受体结合模拟软件。
boxit 2007 DEMO 管理生物样品的数据库系统。
GRR 1.2.1.41 检测系谱误差(pedigree errors)的应用软件。
AceDB 4.9u 基因组数据库软件。
MAPL98、DIAL98与GEST98 日本学者编制的几个统计基因学（Statistical Genetics ）软件。
PED 4.2 系谱(Pedigree)绘制软件。
PEDRAW 2.5 系谱(Pedigree)绘制软件。
MassXpert 帮助科学家预测与分析从蛋白组学研究中获得的蛋白质质谱数据的软件。
WinMDI ver 2.9 分析流式细胞仪数据文件的免费软件。
TestDNA 根据已知成份值生成细胞周期FCS文件的免费工具软件。
Cylchred 1.0.2 细胞周期分析（CELL CYCLE ANALYSIS）软件。
Flow Cytometer Simulator 流式细胞仪模拟软件
FCS File Mixer和FCS File Sanitizer 两个流式细胞仪相关免费软件。
生物五笔2002f 生物医学专业输入法。
MapDraw 2.1 遗传连锁图绘制软件。
E-Cell 3.1.105 对生物细胞等大型复杂系统进行建模，模拟和分析软件。
生物医学计算器(BioMedCalc)2.9 用于生物医学计算的生物信息学专业软件。
WEASEL 2.4 JAVA语言写的流式细胞分析软件。
REtools 2.01 实验室限制酶管理软件。
PEDIGREE VIEWER 5.5 制遗传图谱软件；
ezFreezer 1.4.3 Demo 冷冻管管理软件。
FCSExpress V3 Demo 流式细胞仪数据分析软件。
Pegasys 0.6 生物信息学流程管理软件
BioDownloader 生物下载器
Pathway Studio 5.0 Trail 代谢途径分析和显示软件；
Cytoscape 2.4.1 java语言编写的显示生物分子交互作用网络的生物信息学软件；
Taverna 1.5.1 在生物信息学研究中使用工作流和分布计算技术工具软件
APP 2.01 免费的免费的途径绘制显示软件
EPE 1.3.0 注释、显示各种生物网络、途径的软件
化学绘图　
ChemDraw Ultra 10.0 Trial 化学绘图软件
JChemPaint 2.21 java语言编写的免费分子结构编辑器。
趣味生物软件　
Microbworld “微生物世界”屏保
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